南京信息工程大学是一所教育部直属、以信息工程为主、工、理、文、管、法多学科协调发展为特色，具有一定信息技术特色和优势的高水平人才培养和科学研究基地。目前，南京信息工程大学既不是“211工程”高校，也不是“985工程”高校，而是入选“卓越工程师教育培养计划（工程）”和“卓越法律人才教育培养计划”，是全国首批硕士学位授权单位，具有博士后流动站设立权。
针对南京信息工程大学的学科建设，其目前拥有软件学院、信息工程学院、自动化学院、航空电子学院、外国语学院、数理学院、经济管理学院、法学院、后勤工程学院等9个学院或系，共有40个本科专业和8个硕士学位授权类别。此外，学校还有10个省级重点学科，其中信息与通信工程学科位列“双一流”建设学科、电气工程学科位列一流学科建设行列。
南京信息工程大学不在“211工程”和“985工程”高校之列，但学校在信息工程方面具有较强的水平和优势，部分学科也已达到国内领先水平，属于我国高水平大学之列。作为一所高水平的大学，南京信息工程大学在发展中还需不断加强各方面的创新实践，为人才培养和社会发展做出更大的贡献。